第二代试管婴儿缺点与人为操作有关，正常情况下，胎儿皆为自然受孕情况下出生。而任何技术皆存在缺点，二代试管婴儿也不例外，在操作时，将精子注入卵子可对精子内部造成稍许损伤，但肉眼无法看出。二代试管婴儿受精率高，但优胚率、囊胚率及妊娠率，与新鲜试管婴儿差别不大，而且流产率约高于5%，高于体外第一代试管婴儿。
第二代试管婴儿的弊端
1、损害精子
因为第二代试管婴儿是在众多的精子中挑选最优秀的精子，然后再将这个精子注射到女性的卵子里面，也就是强制性的让他们受精成功。
2、缺陷率高
因为第二代试管婴儿的精子，它只能通过肉眼来进行宏观观察。所以在挑选的时候很有可能因为他的外表而导致对他错误的认知，将外表长得比较好，颜值比较高的精子，以为是优秀的精子来完成受精。所以他在这种程度上存在的缺陷是比其他试管都要高很多的。
3、妊娠率比较低
虽然说第二代试管婴儿受精率还不错，但是，大多数情况下都会被她的外表所欺骗，所以说他的优质的胚胎的概率是比其他也要低很多的。
4、流产率也稍高
通过很多数据我们可以知道在做完第二代试管婴儿怀孕之后，它的流产的概率能够达到5%。
5、总体费用稍高
其实第二代试管婴儿手术就是在第一代的基础之上进行一定的进化。其中还增加了一些精子注射的技术，所以就导致它的技术要求会更高，自然二代试管婴儿费用也会比一代高5000-10000元不等。
5、存在遗传
第二代试管婴儿其实就是辅助受精的过程。所以说他的受精几率还是会高一些，但是他的受孕方法是有一点违背自然规则的，所以在一定程度上是可能会出现遗传问题。
二代试管婴儿的孩子是否健康
二代试管和一代试管对比起来还是会略微及先进很多，在技术方面也有了一些更新换代，当然缺陷也是会会有一些的，但是出生的孩子到底健康还是不健康，这还需要从很多个方面来一同决定的。如果说在试管的时候女性和男性没有讲自己的身体照料好，可能就会出现精子和卵子不能健康的结合，这种情况就会是生下来的还在存在一些潜在的缺陷问题。
以上这就是为大家讲解的有关于第二代试管婴儿存在的一些缺陷，所以到底是否需要第二代试管婴儿来进行助孕，还是更多的要根据自己自身的身体条件来进行判断选择。
