囊胚移植有避免多胎妊娠、着床率高、稳定性好、降低宫外孕的发生率、更具有发育潜能等优点。囊胚移植后在子宫大概游走2-4天就会开始着床，一般在一个星期左右就会完成着床，相比较其他的胚胎游走的时间更短，着床的时间更快一些，而且囊胚的着床率明显高于胚胎的着床率，所以如果能够顺利的培养出能够进行移植的囊胚，就可以很大的提高试管婴儿妊娠率。
囊胚移植的优点
提高了着床率
根据相关研究发现，囊胚和子宫内膜环境更加协调一致，在一定程度上增加了胚胎的着床率。此外，囊胚出现异常的几率要低于其他胚胎，再加上囊胚移植一般只会选择优质的，这样就减少了多胎妊娠的风险，在某种程度上提高了着床率。
遗传学诊断的准确性高
囊胚培养可以进行胚胎遗传学诊断，因为囊胚已经发育到200-300个细胞，可以活检5个左右的滋养层细胞进行遗传学分析，能在体外进行更多的筛选，从而提高遗传学诊断的准确性。
降低宫外孕的发生率
囊胚的体积要比其他胚胎大，特别是已经孵出的囊胚体积更大。因为体积大的原因，囊胚很难进入输卵管，同时会快速准备着床，这样就减少胚胎游走的时间，可以在一定程度上降低宫外孕的发生率。
更具有发育潜能
早期胚胎发育在移植到子宫后，还需要发育一段时间达到囊胚期之后，才能证实哪些胚胎是发育受限或是无发育潜能的，而这就很可能引发女性移植后出现胎停育、流产的情况。而囊胚已经在体外培育了5-6天了，可以让专家更准确的选择移植质量好且有发育潜能的胚胎，而囊胚移植后也可以更好地适应子宫环境。
避免多胎妊娠率
在早期的试管婴儿治疗中，为了试管移植的成功率，往往会给女性移植2-3个左右的早期胚胎。如果这几个胚胎都存活下来了，那就出现了多胎妊娠的情况。有些女性的子宫和身体情况是不适合多胎妊娠的，很有可能引发流产和早产的情况，所以就需要去做减胎手术。可移植囊胚的成功率要比早期胚胎要来得高了，还能避免多胎妊娠率的发生。
