苏州大学附属第二医院始建于1988年，又名核工业总医院、中法友好医院，是一所集医疗、教学、科研、预防、应急等为一体的三级甲等医院，也是苏州大学医学部第二临床医学院、国家卫生健康委核事故医学应急中心第四临床部。医院是国家临床医学博士后流动站，临床医学一级学科博士、硕士学位授予点，住院医师规范化培训基地，国家药物临床试验基地。医院设有国家重点实验室临床中心、放射医学转化中心、核技术临床研究中心、苏州市放射治疗学临床医学中心、苏州市神经疾病临床医学中心、苏州市神经外科临床医学中心、苏州市骨科临床医学中心、苏州市骨质疏松临床医学中心，4个苏州大学研究所、10个市重点实验室。
医院正在建设“全国一流三甲医院、核特色鲜明的一流大学附属医院、高度国际化医教研融合临床研究中心。”医院现由三香路院区、络香路院区、浒关院区和西环路院区组成，共设床位2050张。医院现有临床科室34个，医技科室14个，职能科室22个,教研室26个，在职员工3201人，高级专家634人，享受国务院政府特殊津贴专家17人，博士生导师50名，硕士生导师145名。
医院科室齐全、综合实力雄厚。医院设有江苏省重点学科4个（放射治疗科、普外科、神经内科、神经外科），江苏省临床重点专科16个（普外科、骨科、神经外科、神经内科、麻醉科、急诊科、放射治疗科、妇科、泌尿外科、心胸外科、消化内科、医学影像科（放射、介入）、检验科、重症医学科、呼吸内科、血液科）；苏州市重点学科8个（神经内科、神经外科、泌尿外科、急诊科、呼吸科、手足外科、胸外科、内分泌科）、苏州市临床重点专科24个（神经外科、神经内科、普外科、麻醉科、急诊医学科、骨科、放射治疗科、胸心外科、妇科、泌尿外科、消化内科、医学影像科（放射、介入）、检验科、重症医学科、呼吸内科、血液内科、心血管内科、整形美容科、产科、肿瘤科、血管外科、药剂科、肾内科、内分泌科）。
90年代初，该院率先在苏州市开展微创手术。神经外科锁孔微创技术国内率先开展，全国领先；普外科是卫生部内镜技术培训基地、国家级腹腔镜外科医师培训基地；消化科内镜中心是中国医师协会内镜医师培训基地；神经内科支架植入等核心技术质控指标位列国家脑防委高级中心第一方阵；显微外科技能培训中心系中国医师协会专科培训基地。
医院是国家高级卒中中心、国家胸痛中心、区域级创伤救治中心、区域级卒中救治中心、市级胸痛救治中心、市危重孕产妇救治中心、国家心衰中心、国家房颤中心、国家脑出血外科诊疗中心、国家保乳示范中心、全国血栓防治中心先进单位等。苏州市健康市民“531”行动倍增计划：市级区域骨质疏松防治指导中心、市级区域慢阻肺防治指导中心、全人群睡眠障碍区域防治指导中心、市级区域代谢性疾病（三高）防治指导中心。
