莆田学院附属医院是福建省最早的医院之一，创建于1896年，前身系英国教会创办的“兴化圣教医院”“莆田圣路加医院”。百余年风雨栉沐，几代人薪火相传，医院已发展成为一所集医疗、教学、科研、急救、预防、康复、保健为一体的大型综合性三级甲等医院。现为国家爱婴医院、全国首批危险性上消化道出血救治区域中心、国家脑出血外科诊疗基地、国家乳腺癌规范诊疗质量控制试点中心、国家住院医师规范化培训基地、国家临床药师培训基地、国家药物临床试验机构、中德脊柱交流中心、中德胸心外科交流中心、美敦力大中华区脊柱微创教育中心。2022年绩效国考成绩进入全国三级综合医院前15%，全市首家挺进全国A级医院行列。
现有教职工2600多人，其中高级职称550人，正副教授59人，博士生、硕士生导师30人，博士后、博士及硕士研究生400余人。开放床位2200张，2023年度总诊疗人次184万，出院人次10万，手术台次3万。设有临床科室56个，医技科室18个，病区40个，专科专病门诊32个。拥有院士工作站1个，省级临床医学研究中心1个，省级重点专科10个，医学硕士联合培养点9个，莆田学院医学研究所10个，临床教研室16个。
各临床学科全面发展，机器人辅助手术、微创手术、介入手术、试管婴儿等新技术广泛应用于临床，形成了“内科外科化，外科微创化，微创精细化”的良好诊疗层次。以疾病为中心开展多学科协同诊疗，全方位提高救治效率和质量，胸痛中心、房颤中心、高血压达标中心、癫痫中心先后通过国家级认证。荣获全国血栓防治中心优秀单位、国家PCCM科规范化建设优秀单位。建成了福建省儿童救治和产前筛查诊断莆田分中心、莆田市唯一生殖医学中心，急危重症综合救治能力不断提升。
2012年经市委、市政府批准成立“莆田学院附属医院医疗集团”，现医疗集团的成员医院19家。2021年获批福建省首批省级区域医疗中心建设医院。2022年，先后与北京大学肿瘤医院、北京大学口腔医院、福建医科大学附属协和医院签订战略合作协议，在硬件设施、学科建设、人才培养、能力提升、运营管理模式等方面实现全方位高位嫁接，共建省级区域医疗中心，全力打造区域医疗高地。
