济宁医学院附属医院始建于1951年，前身为济宁红十字会医院，是集医疗、教学、科研、预防保健、指导基层为一体的三级甲等综合医院。建院以来，医院始终坚持“一切为了大众健康”的服务宗旨，2015年，被确定为省级区域医疗中心，在国家三级公立医院绩效考核中，连续5年全国百强，国家监测指标等级A+；在山东省卫生健康事业单位绩效考核中连续4年考核优秀。医院获得国家卫健委2018—2020年改善医疗服务先进典型通报表扬，国家卫健委财务司“全国医疗服务价格和成本监测网络先进机构”称号等。
医院现拥有两个院区，院本部和太白湖院区，开放床位4100张，员工5663人，博士后、博士、硕士人员1962人，承担着鲁西南地区2000多万人口的医疗保健任务。医院年均门诊量400万人次，住院量约25万次，平均住院日降至6.2天，主要业务指标和质量效益指标继续保持国内同级医院优秀水平，综合服务能力在山东省位居前列。医院积极推动优质医疗资源下沉，牵头建立医联体单位57家，紧密型医联体医院2家，市专科联盟19个，覆盖10省22地市206个基层医疗机构。
医院拥有世界先进的第四代达·芬奇手术机器人、PETCT、双源螺旋CT、ECT、3.0T磁共振、直线加速器、DSA、全飞秒激光屈光手术仪等大型医疗设备，其中万元以上大型医疗设备9400余台（件）。医疗设备总值达到16.96亿元。
医院不断开展技术攻关和创新，特色医疗项目优势明显。先后成功开展了山东省首例同位异体心脏移植手术、鲁西南首例肝脏移植手术、肾脏移植术，完全自主成功开展异基因造血干细胞移植技术、鲁西南首例ECMO体外膜肺氧合技术、鲁西南首例全飞秒激光屈光手术、山东省首例第四代达芬奇机器人手术等。达芬奇手术机器人的启用使医院迈入“手术机器人时代”。器官捐献工作有序推进。ECMO应用平台步入正轨，成功抢救多例患者生命。
医院现有国家临床重点专科及建设项目4个（骨科、内分泌科、心内科、临床护理），省专科区域医疗中心1个，省临床重点专科26个，省中医药临床重点专科1个，省临床精品特色专科5个，省医药卫生重点学科7个，省医药卫生重点实验室3个，省教育厅高校特色实验室1个。在心脑血管病的应急救治效率和成人康复诊疗水平处于省内先进水平，在急危重症与疑难复杂疾病救治方面处于国内先进水平，已形成以心脏外科、心脏内科、神经内科、重症医学、神经外科、骨科、血液科、妇产科、儿科等为专长，以急危重症救治为特色的区域性综合性医疗中心。医院先后被评定为中国初级创伤救治培训基地、国家急性心肌梗塞救治项目山东培训基地、国家内镜与微创医学培训基地、国家级住院医师规范化培训基地、国家级心血管介入诊疗准入和培训基地、国家临床药师培训基地、省级生殖医学中心、省级产前诊断中心、省级专科护士培训基地等。
医院坚持“科技强院”“人才强院”，坚持把人才作为支撑发展的第一资源。实施人才强院战略和“12353”人才工程。现拥有享受国务院政府特殊津贴1名，省有突出贡献的中青年专家、泰山学者青年专家等省市高层次人才47名，形成尊重人才、培养人才、服务人才、成就人才的良好生态，为医院两院区高质量发展奠定坚实基础。医院现在研国家自然科学基金40余项，省自然科学基金100余项，临床研究科研成果转化近270万元。医院形成了领军人才、专家学者、学术带头人与青年才俊梯次搭配、优势互补的格局，多次被授予“山东省人才工作先进单位”称号。
医院积极响应国家公立医院改革号召，深化人事分配制度改革，取消药品加成，优化门诊预约和服务流程，深入推进临床路径以及日间手术等工作落实，就医群众感受明显改善。在国家绩效考核中，门诊患者满意度、住院患者满意度、医务人员满意度均达到满分。医院开展了“爱心医疗救助工程”，连续18年每年为100位家庭贫困先心患儿免费实施手术，现已成功为2100余名贫困先心病患儿实施爱心救助，2021年增设早产儿救助，“大爱无疆”服务品牌受到社会广泛赞誉。社区“健康之家”服务和辐射作用日益显现，积极探索和推进分级诊疗工作，探索建立了学科型、项目型医联体模式。
2021年5月1日，济医附院太白湖院区（一期）正式启用，院区总建筑面积23.5万平方米，设计床位1500张，大大改善了驻地群众就医条件。太白湖院区的启用标志着医院进入“一院两区”发展时代，是医院发展史上具有里程碑意义的一件大事。医院将把太白湖院区打造成国家级绿色医院，并统筹“一院两区”构建新的发展格局，全面实现两个院区高质量协同发展。新院区运转情况良好，最大程度发挥了新院区功能，有效满足了人民群众就医需求，完善了太白湖新区服务功能，得到了社会各界的高度评价。
于所取得的成绩，医院先后荣膺全国五一劳动奖状、全国卫生系统先进集体、全国先进基层党组织、全国精神文明建设先进单位、全国百姓放心百佳示范医院、全国模范职工之家、全国改善医疗服务示范医院、全民健康管理示范医院、全国巾帼建功先进集体等多项国家级荣誉。医院跻身全国综合医疗机构互联网品牌传播100强。
医院将继续坚持“一切为了大众健康”的服务宗旨，努力把医院打造成为集医疗服务、科学研究及人才培养为一体的特色鲜明、国内知名的区域医学中心，为人民群众健康保驾护航。
