深圳市妇幼保健院建于1979年，2002年与深圳市妇女儿童医院合并，现已发展成为一家集保健、预防、医疗、教学、科研为一体的国内知名三级甲等妇幼保健院，是多所高校教学医院和实习基地。
医院一院两址，分别为红荔院区和福强院区，占地面积3.5万平方米，建筑面积14万平方米。2023年门急诊量195.62万人次，出院6.03万人次，分娩量1.63万例。
截至2023年12月，全院在岗职工2333人，卫生专业技术人员2035人，占全院职工87.23%；现有正高186人，副高306人，博士106人，硕士600人；博士生导师5人，硕士生导师60人。拥有地方级领军人才4人，“孔雀计划”C类人才7人，临床型实用人才2人，后备级人才5人，特聘岗位9人。
医院专科设置齐全。设有产科、妇科、新生儿科、儿科、儿外科、生殖医学科、中医科、针灸推拿科、乳腺科、口腔病科、急诊科、麻醉科、医学遗传中心、检验科、病理科、放射科、超声科、药剂科、产前诊断中心、妇女健康科、儿童健康科等30多个业务科室；具有第三代试管婴儿技术（胚胎植入前遗传学检测技术，PGT）正式运行资质。
妇幼保健体系建设完善。目前已在全市建立以深圳市妇幼保健院为龙头，各区妇幼保健院为支撑，由市、区妇幼保健院、综合医院、社康中心组成的两级三层妇幼保健网络，全市孕产妇死亡率、婴儿死亡率、5岁以下儿童死亡率等妇幼健康核心指标保持在发达国家水平，妇女儿童健康水平稳居全国前列。
学科建设稳步推进。拥有1个国家临床重点专科：新生儿科；2个国家保健特色专科：新生儿保健特色专科、孕产期保健特色专科；1个广东省高水平临床重点专科：新生儿科；2个广东省临床重点专科：产科、儿科；2个广东省保健特色专科：新生儿保健特色专科、更年期保健特色专科；1个广东省中医重点专科：中医妇科；4个深圳市医学重点专科：产科、新生儿科 、生殖医学科、妇幼卫生与儿童保健专科；1个深圳市中医特色专科:中医妇科；2个深圳市重点实验室：深圳市孕产疾病与母婴健康重点实验室、深圳市出生缺陷预防控制重点实验室。拥有全国首批产前超声培训基地、全国新生儿围产期医学专科医师培训基地、全国子宫颈癌早诊早治示范基地、国家级儿童早期发展示范基地等多个国家级基地。
科研水平显著提高。国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目等重大科研项目立项获得历史性突破，2023年国家自然科学基金项目、SCI论文数和影响因子均创新高，近五年课题总经费达6200余万。加大科研投入和完善科研激励机制，设立院内科研基金项目，培育优秀科研人才。近年获中华医学科技奖、宋庆龄儿科医学奖、国家卫生健康委科技兴院典型奖、广东省科技进步奖4项、深圳市科技进步奖8项。“医疗卫生三名工程”项目稳步推进，现有7个“三名工程”团队，在引进团队的指导下，依托科室学科建设与综合实力提升显著。目前是国家药物/医疗器械临床试验机构，现已备案有妇科、产科、新生儿科、儿科、医学遗传中心、检验、口腔、皮肤科等具有妇幼特色的药械专业组30余个，承接项目逐年递增。
近几年在各级综合绩效考核及评价中获得优异成绩。2020年度国家卫生健康委首次全国妇幼保健机构绩效考核中，排名全国第五；广东省三级妇幼保健机构绩效考核排名全省第一。荣获2023年广东省医疗系统先进集体表彰。
院党委重视党建工作，坚持把方向、管大局、作决策、促改革、保落实的领导作用；充分发挥群团组织作用，开办卫生系统首个“职工子女假期托管班”和首个“青年综合素质培训班”，定期举办文艺汇演、歌手大赛及“青年论坛”等活动；院工会成立多个兴趣小组，努力打造职工和患者喜闻乐见的文化品牌，为医院建设和发展铸魂立魄。
面对新征程，医院将秉承“保障母婴安康、提高出生人口素质”的办院宗旨，弘扬“团结、耐劳、慎独、向上”的院训精神，大力推进医院学科建设和人才培养，实现我院医疗、教学和科研全方位发展，努力构建国内一流的集约型、服务型、创新型妇幼保健服务体系，向“树立市妇幼优质品牌，打造广深医疗高地，创建粤港澳大湾区妇幼保健医疗中心，推进健康深圳建设”的目标努力奋斗。
